深空探秘是第二银河中充满惊喜的玩法，推荐使用高机动性的巡洋舰或战列巡洋舰，比如晨曦经合体的渊级或斯瓦罗斯共和国的级，它们不仅速度快，还能在遭遇敌人时灵活应对。渊级的跳跃能力特别适合放风筝战术，而级的暴击率和冷却缩减则能快速解决战斗。
深空探秘的核心玩法是解密星图数据并寻找秘藏，因此续航和防御同样重要。战列巡洋舰如灵感级凭借高输出的粒子炮和能源核心加成，能轻松应对突发战斗。如果更注重生存，可以选择天启帝国的激光炮舰船，它们的热能抗性较高，面对敌方火力时更持久。舰船被摧毁后携带的物品可能掉落，所以尽量避开高风险区域。
解密星图时，优先选择高品质数据，它们会指向价值更高的宝藏。解密过程需要耐心匹配图案，如果觉得麻烦，可以直接支付信用点让AI代劳。完成解密后，系统会标记秘藏坐标，这时记得检查舰船状态，确保护盾和能量充足。
探索过程中可能会遭遇海盗或其他玩家，保持警惕并随时准备撤退。粒子炮和磁轨炮适合中远程战斗，而导弹和激光炮在近距离表现更稳定。电子战模块能干扰敌人锁定，护盾回充装置则能提升生存能力。深空探秘的奖励包括稀有蓝图和资源。
