巫婆沼泽是游戏中后期才能解锁的重要隐藏区域，位于温泉东北方向。该区域初始被岩石阻挡，需完成黑暗护身符任务后才能进入。沼泽内部有女巫小屋和她的仆从，玩家需提交虚空蛋黄酱才能通过守卫。小屋内的墨水道具可解锁魔法建筑功能，并且小屋与法师地下室存在快速传送通道。隧道区域位于巴士站左侧公路尽头，相对容易被发现，但许多玩家不知道这里是齐先生任务的起点区域。
下水道系统是星露谷最容易被忽略的隐藏地点之一，入口位于鹈鹕镇南部和煤矿森林南部的两个下水道口。解锁需要生锈的钥匙，通过向博物馆捐赠60件古物或矿物获得。下水道内部不仅有商人科罗布斯，还连接着突变虫穴区域。突变虫穴是后期获取虫肉和纤维的重要场所，也是唯一能钓到史莱姆鱼的地点，但需要先完成法师的黑暗护身符任务并与科罗布斯对话才能进入。
精通山洞位于煤矿森林东部，需要玩家五项技能全部达到10级才会开放。这个区域因位置隐蔽且解锁条件苛刻，常有玩家游戏多年都未曾发现。秘密森林入口在法师塔上方和玛妮商店西侧，初期被横木阻挡，需要钢斧才能清除障碍。森林内每天刷新六个硬木树桩，其中两个隐藏在下方密道中，是获取硬木的重要来源。
姜岛上的火山地牢和海盗湾是后期新增的隐藏区域。火山地牢北面存在直达矮人锻造台的捷径，但需要先通关一次地牢才能解锁。海盗湾位于岛屿东南部，必须在重建海滩度假村后才能进入，此前道路被废墟阻挡。这些区域不仅提供独特资源，还包含特殊剧情和任务线。
